结算漏项如何处理？？？

总是在网上看到询问做结算的技巧，挖空心思的做多。可是我碰到的却是能算进去的都不算，因为标底投标的时候没有这些项目。可实际很多项目都做了，例如沟槽连接的管件、管道刷油保温防腐等。。。。。。
科长给我的解释是算那么多，甲方又不会给你。他的意思是少算点的，甲方才会爽快的给钱。我不明白又不是无端做多，能争取的，我们尽量争取，在结算的前期，施工过程中做好伏笔。请问问我的想法有错吗？